Харківський дельфінарій входить до складу національної мережі культурно-оздоровчих комплексів "Немо". Серед основних завдань – популяризація знань про морських ссавців, пропаганда природоохоронних ідей. Створення даного комплексу є одним із заходів щодо захисту та збереження зникають і скорочуються популяцій морських ссавців.
Також у дельфінарії проводяться сеанси дельфінотерапії, яка є ефективним методом безмедикаментозного оздоровлення та реабілітації дітей із функціональними обмеженнями.